杏林大學(xué)設有四個(gè)學(xué)部，分別為醫學(xué)部（醫學(xué)科）、保健學(xué)部（臨床檢查技術(shù)學(xué)科、健康福祉學(xué)科、看護學(xué)科、臨床工學(xué)科、緊急救護學(xué)科、理學(xué)療法學(xué)科）、綜合政策學(xué)部（綜合政策學(xué)科、企業(yè)經(jīng)營(yíng)學(xué)科）、外國語(yǔ)學(xué)部。大學(xué)院設有醫學(xué)研究科（生理學(xué)系專(zhuān)攻、病理系專(zhuān)攻、社會(huì )醫學(xué)系專(zhuān)攻、內科系專(zhuān)攻、外科系專(zhuān)攻）、保健學(xué)研究科（保健學(xué)專(zhuān)攻、看護學(xué)專(zhuān)攻）、國際協(xié)力研究科（國際開(kāi)發(fā)專(zhuān)攻、國際文化交流專(zhuān)攻、國際醫療協(xié)力專(zhuān)攻、開(kāi)發(fā)問(wèn)題專(zhuān)攻），以及日本語(yǔ)研修課程。校長(cháng)致辭（摘選）：21世紀，是必須以全球規模的眼光來(lái)考慮一切事物的時(shí)代。杏林大學(xué)正是立足于這個(gè)視點(diǎn)，不僅教授學(xué)生們學(xué)習各專(zhuān)業(yè)分野的知識，而且還要培養出可以以發(fā)展性的廣闊視野來(lái)思考，并且自律的人材。