自治醫科大學(xué)最初在1972年設立之時(shí)的目標是，確保和提高偏遠地區的醫療體系，并且增進(jìn)當地居民的福祉。學(xué)校的教育目的是培養堅持醫療道德，并且同時(shí)具有較高臨床實(shí)力的醫師，以醫學(xué)的進(jìn)步和提高當地住民的福祉為使命。自治醫科大學(xué)是由在地域醫療體系中負責的全國各都道府縣共同創(chuàng )立的學(xué)校法人進(jìn)行運營(yíng)的。本校的學(xué)生們，可以通過(guò)在校6年時(shí)間的住校生活，共同的起居，蘊育出自律協(xié)調的精神和責任感。同時(shí)，通過(guò)加強與都道府縣的聯(lián)系，努力使學(xué)生們加深對偏僻地域醫療現狀的認識，鞏固對人道醫療的使命感。